More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1030 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  99.18 
 
 
489 aa  954    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  100 
 
 
489 aa  960    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  74.08 
 
 
489 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  100 
 
 
489 aa  960    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  100 
 
 
489 aa  960    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  99.8 
 
 
516 aa  960    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  74.29 
 
 
489 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  71.57 
 
 
488 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  100 
 
 
489 aa  960    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  88.5 
 
 
484 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  74.08 
 
 
489 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  99.18 
 
 
489 aa  955    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  73.17 
 
 
491 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  72.67 
 
 
491 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  52.82 
 
 
520 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  52.82 
 
 
520 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  52.13 
 
 
538 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  46 
 
 
503 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  59.53 
 
 
401 aa  392  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  46.84 
 
 
484 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.91 
 
 
433 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  46.73 
 
 
484 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  55.03 
 
 
407 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  56.6 
 
 
456 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.7 
 
 
531 aa  361  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  53.08 
 
 
416 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  54.12 
 
 
422 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  55.03 
 
 
404 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  54.55 
 
 
404 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  54.28 
 
 
404 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  52.8 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  53.57 
 
 
404 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  52.66 
 
 
416 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  52.66 
 
 
416 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  52.66 
 
 
416 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  52.66 
 
 
416 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  50 
 
 
410 aa  330  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  54.49 
 
 
397 aa  329  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  39.45 
 
 
509 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  42.64 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  46.33 
 
 
421 aa  306  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  44.28 
 
 
400 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.15 
 
 
457 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.15 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  40.37 
 
 
459 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.96 
 
 
454 aa  216  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.95 
 
 
457 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 
459 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  38.8 
 
 
423 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  37.85 
 
 
410 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.7 
 
 
400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  36.28 
 
 
424 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  31.2 
 
 
399 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 
427 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  35.53 
 
 
399 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  30.61 
 
 
398 aa  170  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.12 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  35.22 
 
 
418 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 
587 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  35.16 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  35.05 
 
 
456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7265  putative cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcB (cation efflux system protein czcB)  36.53 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0692053  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 
399 aa  140  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0616  RND family efflux transporter MFP subunit  39.27 
 
 
329 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4531  secretion protein HlyD  37.9 
 
 
316 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.65 
 
 
376 aa  136  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  39.39 
 
 
327 aa  136  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.06 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  38.07 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.99 
 
 
331 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.52 
 
 
424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.62 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  29.93 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  38.66 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  33.24 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  36.55 
 
 
417 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  36.04 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  35.62 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  36.32 
 
 
331 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  28.92 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  31.58 
 
 
308 aa  127  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  38.14 
 
 
329 aa  127  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  34.39 
 
 
389 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4155  RND family efflux transporter MFP subunit  31.92 
 
 
313 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.259995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  30.08 
 
 
361 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  33.12 
 
 
371 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 
402 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2372  HelB protein  36.08 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 
364 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  33.88 
 
 
385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 
365 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 
390 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  30.29 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 
361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  29.81 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  28.01 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.34 
 
 
397 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  25.48 
 
 
368 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>