236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1886 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  89.39 
 
 		 575 aa  982    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 573 aa  1113    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  41.67 
 
 		 583 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.59 
 
 		 579 aa  359  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.62 
 
 		 575 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.48 
 
 		 579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.08 
 
 		 579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.94 
 
 		 573 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.52 
 
 		 583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  40.65 
 
 		 581 aa  317  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.48 
 
 		 569 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  38.96 
 
 		 564 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  37.81 
 
 		 575 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.77 
 
 		 575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  38.59 
 
 		 544 aa  283  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  35.89 
 
 		 563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  41.3 
 
 		 372 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  38.61 
 
 		 370 aa  217  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  38.61 
 
 		 370 aa  217  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  42.06 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38 
 
 		 371 aa  206  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  41.64 
 
 		 340 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  39.39 
 
 		 377 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  38.69 
 
 		 369 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  41.11 
 
 		 372 aa  190  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  38.29 
 
 		 366 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  38.04 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  38.14 
 
 		 187 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  38.14 
 
 		 187 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 705 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  34.72 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  37.98 
 
 		 186 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  39.6 
 
 		 180 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  39.69 
 
 		 185 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 627 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  38.66 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 		 537 aa  67  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.91 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  32.86 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.71 
 
 		 406 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 538 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  28.03 
 
 		 527 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.94 
 
 		 390 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  25.54 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  28.36 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.88 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  34.29 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  28.99 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 364 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1144  hypothetical protein  35.38 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.77 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  21.78 
 
 		 404 aa  57  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  29.3 
 
 		 398 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 640 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  25.84 
 
 		 382 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.37 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 504 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  28.72 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 379 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  25.24 
 
 		 384 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  26.01 
 
 		 473 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 582 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  27.54 
 
 		 374 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 		 473 aa  54.3  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 412 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  26.6 
 
 		 372 aa  54.3  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.99 
 
 		 398 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 553 aa  53.9  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 381 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  27.34 
 
 		 372 aa  53.5  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 		 411 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 374 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  27.41 
 
 		 550 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  26.54 
 
 		 381 aa  51.6  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  26.49 
 
 		 502 aa  51.6  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 607 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  24.31 
 
 		 361 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  25.27 
 
 		 381 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  26.24 
 
 		 524 aa  51.2  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  22.16 
 
 		 368 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 494 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>