More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6772 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 424 aa  858    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  38.68 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.13 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.16 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  31.6 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.31 
 
 		 416 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.5 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.67 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.71 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  26.91 
 
 		 396 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  28.62 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.29 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.15 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  25.59 
 
 		 390 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  23.87 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  27.74 
 
 		 386 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  29.3 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  25.41 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  24.06 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  22.71 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  34.87 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  25.67 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  26.03 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  28.94 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  25.56 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  26.8 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.11 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  23.75 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.11 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  30.08 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.08 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1050  hypothetical protein  34.21 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  28.67 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  29 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  24.54 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.51 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.38 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.38 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.34 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  23.19 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 531 aa  76.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 640 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.38 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  26.49 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  28.15 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  25.38 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.72 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  21.97 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  22.52 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  25.28 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.25 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  23.01 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.05 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  23.45 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  23.84 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  24.69 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  22.74 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  30.25 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  25 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  25.86 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.43 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  23.57 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>