More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0996 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 381 aa  786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.53 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  48.55 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  48.75 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.41 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  33.25 
 
 		 422 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  32.47 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.81 
 
 		 426 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34 
 
 		 411 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.96 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.67 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.86 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  28.49 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  27.59 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  29.01 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  28.98 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  25.3 
 
 		 418 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 410 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.6 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 467 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.5 
 
 		 427 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  26.24 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  28.87 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 428 aa  92.8  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  24.37 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  26.81 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  24.68 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  27.08 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  25.07 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  23.58 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.61 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  23.93 
 
 		 365 aa  89.7  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  24.94 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  22.77 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  23.3 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  26.69 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 		 459 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  25.8 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.44 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  27.32 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  25.08 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  26 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.75 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  26.85 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  29.01 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  24.48 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  29.63 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  25.5 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  25.14 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.14 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  23.42 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  25.73 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  28.01 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  23.3 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.69 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 671 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  24.13 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  24.59 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  26.35 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  24.2 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  24.6 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  22.33 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  24.83 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.01 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  23.01 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  22.54 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  27.02 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  27.42 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.01 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.96 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  25.54 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  23.67 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  28.91 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>