More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3932 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 376 aa  766    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.55 
 
 		 381 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.34 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  45.68 
 
 		 391 aa  335  9e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.16 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  32.11 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  29.35 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  27.44 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  28.14 
 
 		 392 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 		 373 aa  115  8.999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  25.66 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 427 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 		 428 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  24.13 
 
 		 404 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  24.13 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 		 538 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  24.78 
 
 		 424 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 		 416 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  24.23 
 
 		 365 aa  95.9  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  23.85 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  23.62 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  24.55 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.2 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  25.62 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  25.23 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  24.38 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.04 
 
 		 454 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 503 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.25 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  22.65 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  22.7 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  24.44 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.51 
 
 		 375 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  26.37 
 
 		 322 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  24.38 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  20.75 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  29.44 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  22.51 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  22.36 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  25.34 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.54 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  26 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  22.39 
 
 		 538 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.27 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  24.15 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  23.67 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  22.92 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  23.59 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.46 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  22.95 
 
 		 578 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.33 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.09 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.46 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.33 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  21.65 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  22.88 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.15 
 
 		 580 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.62 
 
 		 531 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  27.33 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  24.26 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  24.79 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.48 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.78 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  24 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  22.4 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  22.53 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  21.27 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  25.77 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  23.1 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  25.54 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  21.26 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  23.03 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  20.47 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 671 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.76 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  20.58 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.57 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>