More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3345 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 421 aa  852    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.25 
 
 		 409 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.72 
 
 		 415 aa  245  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  39.63 
 
 		 422 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.5 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.07 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  29.78 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  33.67 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.26 
 
 		 381 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  30.38 
 
 		 376 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.44 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.13 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  24.46 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  26.46 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 		 468 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  23.39 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.73 
 
 		 455 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  25.53 
 
 		 349 aa  86.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  23.76 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  23.72 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  24.53 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 580 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  22.61 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  24.77 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.47 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  22.73 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.4 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.51 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  23.98 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  23.44 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  23.33 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.57 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  25.68 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.78 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  24.36 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  23.32 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.6 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  24.05 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  26.64 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  23.13 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  24.82 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  23.85 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  25 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  23.47 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  24.83 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  23.16 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  23.38 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.46 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.19 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  24.49 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  24.83 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  27.68 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  25.51 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  24.62 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  24 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.53 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  27.08 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  23.27 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  21.14 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  25.86 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.26 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  21.52 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  23.45 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>