More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6756 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 411 aa  822    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.62 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.16 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  38.85 
 
 		 422 aa  273  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.38 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  37.27 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  34.9 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.77 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  31.68 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  30.71 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 		 409 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  33.25 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  26.54 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  26.65 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  26.45 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  28.32 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  26.77 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  26.86 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  27.61 
 
 		 538 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  29.08 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  26.78 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.67 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.5 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  27.89 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  25.68 
 
 		 484 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.02 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  27.63 
 
 		 382 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 		 455 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  26.32 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 		 627 aa  94  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  25.07 
 
 		 484 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  29.12 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 503 aa  93.6  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 		 472 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  32.66 
 
 		 322 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 504 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 627 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  25.68 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.84 
 
 		 607 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  25.68 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  30.62 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  25.81 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 482 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.1 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 482 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  27.67 
 
 		 478 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 489 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  25.26 
 
 		 489 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 491 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 502 aa  89.7  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 512 aa  90.1  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.75 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  31.66 
 
 		 322 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 		 580 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  24.66 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 489 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  32.16 
 
 		 322 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  26.9 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  25.43 
 
 		 527 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  25.74 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  27.12 
 
 		 477 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  26.48 
 
 		 488 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  22.97 
 
 		 538 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  25.4 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 382 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.97 
 
 		 537 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 486 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>