More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2690 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 416 aa  846    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  46.01 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  38.12 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3176  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.59 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.38 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  39.62 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.41 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.92 
 
 		 409 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.31 
 
 		 424 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.16 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  31.16 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  31.25 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.95 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  24.64 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  25.59 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.39 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 457 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.32 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  23.39 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 428 aa  93.2  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  24.56 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.31 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  26.43 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 531 aa  90.1  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.68 
 
 		 373 aa  90.1  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  24.28 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  24.85 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 538 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  24.46 
 
 		 383 aa  87.8  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  21.93 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  21.84 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  22.99 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.64 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  24.09 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  22.29 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.65 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  21.12 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  24.33 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  23.7 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  26.15 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.84 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  24.78 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  23.42 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  24.78 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  22.73 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  23.94 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  27.43 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  27.86 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  24.91 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  23.79 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  26.84 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  22.37 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  22.37 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  23.67 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.77 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  22.03 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  24.7 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  22.5 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  24.6 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2147  secretion protein HlyD  24.09 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  24.91 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  23.41 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.63 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  24.61 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  23.43 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.46 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  23.41 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  23.1 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  27.46 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  22.83 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  20.82 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  23.88 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>