More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3686 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 440 aa  876    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  50.56 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  51.4 
 
 		 413 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.28 
 
 		 412 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  43.09 
 
 		 418 aa  316  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.02 
 
 		 417 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  43.02 
 
 		 417 aa  315  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  44.63 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.74 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3470  HlyD family heavy metal efflux pump  35.85 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  34.2 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 		 384 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.389098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2753  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.853922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 		 384 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 		 384 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.905544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  31.47 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5320  heavy metal cation tricomponent efflux protein ZniB  30.97 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  33.54 
 
 		 344 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.54 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  28.82 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  27.75 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  29.86 
 
 		 386 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  29.34 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  32.62 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  35.27 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.48 
 
 		 376 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  29.51 
 
 		 466 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  30.75 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.1 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.27 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.1 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 374 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.85 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  28.75 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  28.88 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.05 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  30.84 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  29.54 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.05 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  33.47 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 366 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.21 
 
 		 366 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  28.62 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  28.65 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  31.41 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 362 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 512 aa  133  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 427 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  30.67 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  25.42 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  30.79 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  31.08 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  33.55 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  30.03 
 
 		 384 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  28.13 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 		 359 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 		 402 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  29.43 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.75 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 581 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  30.77 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.73 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  25.36 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.07 
 
 		 568 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.07 
 
 		 526 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 400 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  34.41 
 
 		 650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  28.4 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 502 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  29.93 
 
 		 527 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  28.4 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  27.71 
 
 		 472 aa  120  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  34.68 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 		 538 aa  118  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 509 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  29.53 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.61 
 
 		 537 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  30.93 
 
 		 253 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  28.1 
 
 		 578 aa  116  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 537 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 671 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 		 640 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  35.68 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  27.76 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>