207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  67.92 
 
 		 370 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  67.92 
 
 		 370 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  67.62 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  64.93 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  64.99 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  66.67 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  65.45 
 
 		 372 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  61.43 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  47.37 
 
 		 368 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  46.39 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  44.51 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.38 
 
 		 575 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.81 
 
 		 579 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 579 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  40.74 
 
 		 583 aa  212  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.25 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.23 
 
 		 583 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  40.34 
 
 		 564 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.29 
 
 		 573 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.32 
 
 		 569 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 581 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  37.69 
 
 		 544 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.09 
 
 		 573 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.36 
 
 		 575 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 575 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 551 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 527 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  22.29 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.62 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  29.53 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  26.2 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 627 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 		 568 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 		 526 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 		 456 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  26.18 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  29.67 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.37 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.36 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  30.5 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  24.08 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  24.14 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.78 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  27.65 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.22 
 
 		 538 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  27.3 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.48 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 540 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3514  RND family efflux transporter MFP subunit  29.25 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  32.99 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  23.41 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.63 
 
 		 460 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  32.79 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  22.52 
 
 		 529 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  26.2 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  26.7 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1427  secretion protein HlyD  23.25 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  27.09 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  23.82 
 
 		 475 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  27.09 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.32 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  26.97 
 
 		 537 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  24.28 
 
 		 418 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0065  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 324 aa  49.7  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.23 
 
 		 361 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1081  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 468 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.82 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  26.71 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.23 
 
 		 361 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>