233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1747 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1103    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  48.36 
 
 		 377 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.79 
 
 		 575 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  47.33 
 
 		 370 aa  300  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  47.33 
 
 		 370 aa  300  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.82 
 
 		 575 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.31 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  36.43 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  48.86 
 
 		 372 aa  293  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.42 
 
 		 579 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.13 
 
 		 573 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.71 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.79 
 
 		 371 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  47.88 
 
 		 370 aa  281  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.97 
 
 		 583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  37.19 
 
 		 581 aa  270  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  36.62 
 
 		 544 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  44.71 
 
 		 368 aa  268  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  50.85 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  38.17 
 
 		 575 aa  266  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  37.14 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  43.28 
 
 		 369 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.88 
 
 		 575 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.25 
 
 		 573 aa  256  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.84 
 
 		 569 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  46.94 
 
 		 366 aa  243  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  41.16 
 
 		 340 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  26.14 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.36 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  34.38 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  25.31 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 		 525 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  35.36 
 
 		 194 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.43 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  32.85 
 
 		 187 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  32.85 
 
 		 187 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  27.43 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  32.89 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  38.3 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  26.01 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0674  periplasmic linker protein  27.3 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0034  secretion protein, HlyD family  22.8 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.58 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  32.37 
 
 		 186 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 		 384 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  25.44 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 553 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  32.58 
 
 		 184 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  28.78 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  27.74 
 
 		 395 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 504 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 380 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 456 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1704  secretion protein HlyD  27.76 
 
 		 345 aa  54.3  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000161104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  31.11 
 
 		 180 aa  54.3  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 		 441 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 		 418 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.78 
 
 		 441 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.85 
 
 		 380 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  26.19 
 
 		 410 aa  53.5  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  24.3 
 
 		 392 aa  53.5  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 		 390 aa  53.5  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 384 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  27.6 
 
 		 371 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  27.27 
 
 		 360 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  29.11 
 
 		 383 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  26.92 
 
 		 524 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.41 
 
 		 512 aa  51.6  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 		 424 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 403 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1144  hypothetical protein  31.91 
 
 		 183 aa  50.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 393 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  25.61 
 
 		 394 aa  50.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.34 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  26.95 
 
 		 387 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.76 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3189  secretion protein HlyD  30.17 
 
 		 401 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3342  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.24 
 
 		 370 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  25.74 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 383 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  25.74 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>