112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1741 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  723    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  65.04 
 
 		 368 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  46.03 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  46.03 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  46.34 
 
 		 370 aa  278  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  46.11 
 
 		 372 aa  276  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  47.09 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  48.7 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.4 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  43.28 
 
 		 563 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  44.78 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  40.51 
 
 		 340 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.53 
 
 		 579 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.94 
 
 		 579 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.23 
 
 		 579 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.69 
 
 		 573 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.78 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  38.6 
 
 		 583 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.6 
 
 		 575 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.43 
 
 		 575 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.45 
 
 		 583 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  37.14 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  36.42 
 
 		 544 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  36.87 
 
 		 581 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.11 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  38.07 
 
 		 575 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.21 
 
 		 573 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.75 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  25.74 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.84 
 
 		 627 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 607 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  24.74 
 
 		 514 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  34.48 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.19 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 		 504 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  24.6 
 
 		 424 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  25.8 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  24.44 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  26.45 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  33.91 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  25.8 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  39.44 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  25.23 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  22.54 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  26.81 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  26.67 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  25.8 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  26.95 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  22.45 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.42 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2547  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  23.74 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  28.69 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 459 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.1 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 360 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 450 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 531 aa  46.2  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.68 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.18 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.870184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  24.68 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  25.36 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  21.52 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  23.95 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.6 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.86 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.99 
 
 		 551 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 582 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  30.6 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 553 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  23.16 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  25.93 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.25 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 450 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>