230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4730 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  89.39 
 
 		 573 aa  982    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 575 aa  1127    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.64 
 
 		 579 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.17 
 
 		 575 aa  357  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  40.98 
 
 		 583 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.23 
 
 		 579 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.42 
 
 		 579 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.64 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.78 
 
 		 573 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  40.07 
 
 		 575 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  39.15 
 
 		 564 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.38 
 
 		 569 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.25 
 
 		 575 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  38.54 
 
 		 581 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  36.79 
 
 		 563 aa  281  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  38.35 
 
 		 544 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  41.64 
 
 		 372 aa  224  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  38.34 
 
 		 370 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  38.34 
 
 		 370 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  40.43 
 
 		 370 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38 
 
 		 371 aa  203  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  39.12 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  41.01 
 
 		 340 aa  196  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  40.28 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  37.6 
 
 		 369 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  38.02 
 
 		 366 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  37.9 
 
 		 368 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  22.65 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 705 aa  71.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  25.84 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 627 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  38.41 
 
 		 207 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  33.86 
 
 		 184 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  32.86 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  34.52 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  38.83 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.76 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  37.21 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  34.29 
 
 		 194 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  28.73 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  26.33 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  26.02 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 538 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  37.41 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.57 
 
 		 424 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  23.88 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  28.32 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  27.9 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 504 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 387 aa  57  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.35 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.63 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  26.47 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 468 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  22.33 
 
 		 404 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 432 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  26.92 
 
 		 372 aa  54.7  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  26.92 
 
 		 372 aa  54.7  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 386 aa  54.7  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.72 
 
 		 364 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 524 aa  54.3  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  23.87 
 
 		 368 aa  53.9  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  26.21 
 
 		 368 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 		 553 aa  53.9  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  29.45 
 
 		 371 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  24.41 
 
 		 382 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 390 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.77 
 
 		 354 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 393 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  26.17 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 374 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  23.76 
 
 		 399 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  30.14 
 
 		 398 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.53 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  22.6 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  23.29 
 
 		 358 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 381 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.28 
 
 		 354 aa  50.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 395 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  25.37 
 
 		 546 aa  50.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  25.14 
 
 		 504 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 345 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  26.78 
 
 		 401 aa  50.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  23.84 
 
 		 526 aa  50.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 369 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  28 
 
 		 550 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>