27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2672 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  61.7 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  65.17 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  50.54 
 
 		 186 aa  151  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  50.53 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  50.53 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  47.28 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1144  hypothetical protein  56.08 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  50.37 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  42.4 
 
 		 583 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  33.97 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.12 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.13 
 
 		 573 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.62 
 
 		 579 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.84 
 
 		 583 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  35.79 
 
 		 207 aa  72  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  41.6 
 
 		 575 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.31 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.16 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  44.35 
 
 		 544 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  40.68 
 
 		 564 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.78 
 
 		 579 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  38.83 
 
 		 581 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.7 
 
 		 569 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.57 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  34.81 
 
 		 563 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.7 
 
 		 575 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>