More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1104 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  84.17 
 
 		 581 aa  890    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  74.01 
 
 		 573 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  70.52 
 
 		 583 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  91.88 
 
 		 579 aa  972    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  92.4 
 
 		 579 aa  993    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  69.04 
 
 		 583 aa  751    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 579 aa  1127    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.97 
 
 		 575 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  61.51 
 
 		 564 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.67 
 
 		 569 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  58.13 
 
 		 575 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.41 
 
 		 575 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  49.02 
 
 		 544 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.06 
 
 		 573 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.9 
 
 		 575 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  36.07 
 
 		 563 aa  283  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  38.52 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  38.52 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  39.31 
 
 		 372 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  41.69 
 
 		 377 aa  207  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.23 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  40.11 
 
 		 370 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  38.46 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  38.94 
 
 		 369 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  37.06 
 
 		 368 aa  190  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  41.06 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  37.17 
 
 		 340 aa  176  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  44.54 
 
 		 186 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  42.98 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  38.64 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25.66 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  24.93 
 
 		 399 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  39.71 
 
 		 185 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.22 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 564 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  23.91 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 		 473 aa  66.6  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  24.86 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3189  secretion protein HlyD  31.43 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.75 
 
 		 354 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.56 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 354 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  31.45 
 
 		 194 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  26.81 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.84 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  23.97 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  39.84 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  23.97 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  39.84 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  31.08 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 		 582 aa  64.3  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  25.5 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  27.66 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  34.48 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 		 356 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3357  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 		 409 aa  63.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.748521  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  22.06 
 
 		 388 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 		 683 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 640 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  30.1 
 
 		 473 aa  62  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 		 346 aa  62  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.67 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.32 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  23.03 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  22.39 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  39.81 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0718692  normal  0.0182823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.41 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  24.86 
 
 		 386 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 		 568 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.41 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  30.98 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0540  RND family efflux transporter MFP subunit  32.8 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  25.15 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  29.57 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.34 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  25.75 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  25.99 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.24 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  25.77 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>