More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2808 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2808  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 378 aa  764    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.635113  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0313  multidrug efflux system protein  41.38 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.06 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61893  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.74 
 
 		 420 aa  242  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1015  RND family efflux transporter MFP subunit  38.48 
 
 		 384 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2730  secretion protein HlyD  39.39 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299945  normal  0.0908172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3631  RND family efflux transporter MFP subunit  39.2 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4470  secretion protein HlyD  39.2 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3896  RND family efflux transporter MFP subunit  39.2 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.51885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4356  RND family efflux transporter MFP subunit  40.27 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6825  HlyD family secretion protein  41.9 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.233447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3971  RND family efflux transporter MFP subunit  39.08 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1953  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 		 367 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2527  RND family efflux transporter MFP subunit  42.49 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16005  normal  0.699583 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  37.35 
 
 		 409 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  36.49 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  37.6 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  35.59 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.23 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  34.71 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  34.82 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.48 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  35.83 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.69 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.51 
 
 		 422 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  35.04 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  32.54 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  33.06 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  34.47 
 
 		 391 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  35.42 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  35.53 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  31.35 
 
 		 426 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  32.71 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  34.07 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.79 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.56 
 
 		 424 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.18 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  32.45 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  36.47 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  36.18 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  33.97 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  34.25 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  33.9 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3539  secretion protein HlyD  33.51 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3329  secretion protein HlyD  35.17 
 
 		 386 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  35.88 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  33.33 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  37.69 
 
 		 391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  35.57 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.16 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  35.99 
 
 		 423 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  35.51 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  34.75 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.16 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  37.12 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.98 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2742  secretion protein HlyD  34.65 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  33.83 
 
 		 430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  33.73 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  30.95 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  31.13 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  32.73 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 412 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  34.08 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.51 
 
 		 411 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 391 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  34.05 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  33.8 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  33.8 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  33.8 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  33.8 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  33.8 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.39 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  33.8 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  32.21 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.61 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.51 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  36.73 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>