More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2527 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2527  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 396 aa  750    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16005  normal  0.699583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.14 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0313  multidrug efflux system protein  66.14 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1015  RND family efflux transporter MFP subunit  55.14 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3631  RND family efflux transporter MFP subunit  61.36 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4356  RND family efflux transporter MFP subunit  63.71 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4470  secretion protein HlyD  61.36 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3971  RND family efflux transporter MFP subunit  58.98 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3896  RND family efflux transporter MFP subunit  61.36 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.51885 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6825  HlyD family secretion protein  61.78 
 
 		 385 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.233447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.38 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61893  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1953  RND family efflux transporter MFP subunit  54.75 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2730  secretion protein HlyD  51.2 
 
 		 388 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299945  normal  0.0908172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  39.9 
 
 		 406 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  43.73 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  41.58 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.26 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  42.36 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  39.4 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2808  RND family efflux transporter MFP subunit  40.63 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.635113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  41.14 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  40.86 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  43.02 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  41.55 
 
 		 447 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.23 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  41.23 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.23 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  41.25 
 
 		 412 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  41.44 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  39.54 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.41 
 
 		 411 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.34 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  41.95 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.21 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  37.77 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  38.52 
 
 		 418 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  38.52 
 
 		 418 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.86 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.42 
 
 		 469 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.02 
 
 		 391 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.42 
 
 		 423 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  42.55 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  42.22 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  40.84 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  41.67 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  44.31 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  40.06 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  37.99 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.74 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.43 
 
 		 424 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  40.4 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  37.75 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  42.35 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  40.8 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.28 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  38.76 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  38.61 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  41.48 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  37.97 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  42.16 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  37.24 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  37.24 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  37.97 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  40.28 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  37.47 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  42.45 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  41.21 
 
 		 409 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  38.92 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  40.05 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  36.01 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  36.01 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  36.01 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  37.13 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.13 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1142  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  42.45 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.25 
 
 		 433 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  40.96 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1622  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  42.45 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  41.33 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  38.79 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  38.48 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  39.14 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  40.97 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4767  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  41.88 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321733  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.76 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.22 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  37.17 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1543  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  39.73 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3329  secretion protein HlyD  39.83 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1520  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  39.89 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  41.03 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  40.28 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.03 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.67 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  36.49 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  41.85 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  40 
 
 		 386 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  38.44 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>