More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1543 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4767  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  93.14 
 
 		 399 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321733  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  91.43 
 
 		 400 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1520  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  97.72 
 
 		 395 aa  705    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1543  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  100 
 
 		 395 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1142  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  92.08 
 
 		 400 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1622  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  92.08 
 
 		 400 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  84.21 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2057  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  75.86 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.408634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1889  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  75.86 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2445  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  78.87 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1903  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  75.86 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00844359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1662  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  75.33 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.018049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0317  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  75.33 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00333189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0843  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  75.33 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.427222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  62.99 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.73 
 
 		 396 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  56.94 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.07 
 
 		 393 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.86 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  49.07 
 
 		 415 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.88 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  50.88 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  47.04 
 
 		 391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  48.04 
 
 		 398 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  47.52 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.61 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.61 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  47.23 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.23 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.98 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  44.53 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  43.99 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  44.1 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  43.09 
 
 		 412 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.09 
 
 		 410 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  44.17 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  43.35 
 
 		 428 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  45.14 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.97 
 
 		 411 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  45.48 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  42.74 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.16 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  43.13 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  40.1 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.73 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  43.49 
 
 		 381 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  39.74 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  43.56 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  46.39 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  43.84 
 
 		 378 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  45.34 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  40.53 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  45.79 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  43.36 
 
 		 400 aa  248  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  45.36 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.24 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.4 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  42.35 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  41.69 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  40.32 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  42.52 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  42.01 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  39.45 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.12 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  40.59 
 
 		 385 aa  242  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  40.76 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  39.31 
 
 		 409 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.65 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  38.23 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  40.4 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  42.7 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  41.38 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  39.31 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  40.32 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.32 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  40.32 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  42.02 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  37.97 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  39.07 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.06 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  39.18 
 
 		 396 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  40.32 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  40.32 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  41.48 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  39.18 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  44.47 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  39.15 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  39.15 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.15 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  44.01 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  39.15 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  39.15 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  39.15 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  40.05 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.17 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  40.68 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.04 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  40.05 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  42.22 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>