More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1953 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1953  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 367 aa  710    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.09 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2730  secretion protein HlyD  51.35 
 
 		 388 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299945  normal  0.0908172 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0313  multidrug efflux system protein  56.16 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3631  RND family efflux transporter MFP subunit  52.6 
 
 		 386 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4470  secretion protein HlyD  52.6 
 
 		 386 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3896  RND family efflux transporter MFP subunit  52.6 
 
 		 386 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.51885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4356  RND family efflux transporter MFP subunit  53.31 
 
 		 386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6825  HlyD family secretion protein  52.2 
 
 		 385 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.233447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.58 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61893  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2527  RND family efflux transporter MFP subunit  54.42 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16005  normal  0.699583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1015  RND family efflux transporter MFP subunit  43.96 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3971  RND family efflux transporter MFP subunit  47.25 
 
 		 385 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  46.76 
 
 		 430 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  43.44 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.46 
 
 		 410 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  43.01 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.88 
 
 		 436 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  43.85 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  43.85 
 
 		 383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  43.01 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  43.89 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.67 
 
 		 424 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  44.23 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  46.96 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  43.94 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  44.29 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.24 
 
 		 423 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  45.63 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  43.87 
 
 		 391 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  45.33 
 
 		 412 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.24 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.92 
 
 		 433 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.27 
 
 		 422 aa  262  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  42.98 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.51 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.92 
 
 		 411 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  41.92 
 
 		 418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  43.47 
 
 		 400 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  41.64 
 
 		 418 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  41.64 
 
 		 418 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  41.48 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  43.12 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  42.47 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  41.48 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.48 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  41.48 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  41.48 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  42.21 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  42.21 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  41.48 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  42.21 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  42.21 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  41.21 
 
 		 385 aa  255  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.22 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  42.61 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  41.21 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  42.27 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  39.83 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  40.83 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  41.21 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  41.05 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  42.35 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  43.24 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  43.64 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3781  secretion protein HlyD  44.32 
 
 		 398 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.012367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  38.12 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  40.68 
 
 		 428 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  38.12 
 
 		 386 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  41.21 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.1 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  40.11 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.11 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  43.64 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  43.01 
 
 		 431 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.21 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  39.62 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.83 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  40.38 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  42.01 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  41.44 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  41.44 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.44 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  41.44 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  39.67 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  41.44 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  39.67 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  41.44 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  41.44 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  41.92 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  39.67 
 
 		 388 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  41.44 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  40.88 
 
 		 397 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  41.16 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  40.82 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  44 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  41.94 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  44.11 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  42.7 
 
 		 420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>