More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4356 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3631  RND family efflux transporter MFP subunit  89.12 
 
 		 386 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4356  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 386 aa  769    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4470  secretion protein HlyD  89.12 
 
 		 386 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3896  RND family efflux transporter MFP subunit  89.12 
 
 		 386 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.51885 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6825  HlyD family secretion protein  87.05 
 
 		 385 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.233447 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0313  multidrug efflux system protein  72.11 
 
 		 385 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.52 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1015  RND family efflux transporter MFP subunit  54.83 
 
 		 384 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2527  RND family efflux transporter MFP subunit  66.01 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16005  normal  0.699583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3971  RND family efflux transporter MFP subunit  57.14 
 
 		 385 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.8 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61893  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2730  secretion protein HlyD  51.32 
 
 		 388 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299945  normal  0.0908172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1953  RND family efflux transporter MFP subunit  51.93 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  44.17 
 
 		 406 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  45.15 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.15 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.55 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  43.66 
 
 		 367 aa  262  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  42.52 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  41.13 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.22 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  41.94 
 
 		 386 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2808  RND family efflux transporter MFP subunit  40.27 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.635113  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  40.68 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  42.51 
 
 		 447 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.23 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  43.09 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  42.36 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.48 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.01 
 
 		 410 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  39.15 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  39.15 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  41.76 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.36 
 
 		 424 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  40.96 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.31 
 
 		 385 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 469 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  40.75 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  37.98 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.13 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.99 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  41.24 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  42.11 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  39.45 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  42.08 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  38.52 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  44.06 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  39.42 
 
 		 415 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3329  secretion protein HlyD  41.6 
 
 		 386 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  39.07 
 
 		 442 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  41.01 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  40.83 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  38.8 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  40.22 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.5 
 
 		 386 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  39.84 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  40.64 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  38.61 
 
 		 395 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  41.95 
 
 		 386 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  41.6 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  39.05 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  38.79 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.28 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  39.14 
 
 		 386 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 415 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.76 
 
 		 390 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  39.17 
 
 		 381 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  38.72 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  39.89 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  38.21 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  38.21 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.44 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.94 
 
 		 436 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  38.79 
 
 		 433 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  43.49 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  39.62 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.21 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  39.23 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  38.74 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.88 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  42.49 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  36.43 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.27 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  40.38 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  39.89 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  37.94 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.14 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  41 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  37.81 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  37.06 
 
 		 387 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  41.6 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>