More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4767 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4767  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  100 
 
 		 399 aa  775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321733  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1543  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  92.73 
 
 		 395 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1142  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  95.5 
 
 		 400 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1520  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  92.64 
 
 		 395 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1622  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  95.5 
 
 		 400 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  95.25 
 
 		 400 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  85.21 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1889  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  79.44 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2057  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  79.44 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.408634  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2445  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  79.44 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0317  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  78.87 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00333189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1662  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  78.87 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.018049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0843  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  78.87 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.427222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1903  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  79.44 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00844359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  60.84 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.76 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  57.18 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.57 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.33 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.32 
 
 		 384 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  50.27 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  48.2 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  50.28 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  49.48 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.41 
 
 		 423 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  47.8 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.41 
 
 		 469 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  44.93 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  47.95 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.81 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  43.13 
 
 		 405 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  46.28 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.28 
 
 		 424 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  41.85 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  45.93 
 
 		 430 aa  276  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  44.38 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  43.6 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  44.71 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.73 
 
 		 410 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  44.57 
 
 		 430 aa  272  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  41.47 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  43.47 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.41 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.27 
 
 		 433 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.2 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  46.48 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  45.64 
 
 		 386 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  46.4 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  41.85 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  45.21 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  45.11 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  43.4 
 
 		 423 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.39 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  43.09 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  43.13 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  42.93 
 
 		 433 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  46.84 
 
 		 430 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  46.74 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  45.54 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  42.47 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.09 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.86 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  43.27 
 
 		 431 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  40.95 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  43.01 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  41.44 
 
 		 401 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  44.35 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.18 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  46.36 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  44.39 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  41.07 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  40.25 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  40.64 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  40.68 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  43.78 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  41.48 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  41.95 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  39.39 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  41.89 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  41.96 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  38.56 
 
 		 442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  40.94 
 
 		 385 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  40.28 
 
 		 418 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  40.28 
 
 		 418 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  39.23 
 
 		 396 aa  245  8e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.02 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 424 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  41.32 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  42.82 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.32 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  40.68 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.68 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  40.68 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  41.54 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  40.68 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.75 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  42.3 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  40.68 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 418 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>