293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2264 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  100 
 
 		 627 aa  1270    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  28.43 
 
 		 500 aa  183  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  34.81 
 
 		 380 aa  98.6  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  26.48 
 
 		 383 aa  93.6  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0320  antibiotic ABC transporter  27.82 
 
 		 324 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  29.53 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.81 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.72 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.72 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.72 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.72 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.98 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  30.34 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.61 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  28.97 
 
 		 460 aa  77  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.34 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.34 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.66 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.41 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0252  secretion protein HlyD family protein  32.09 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0328  hypothetical protein  32.09 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00489922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.66 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.34 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  26.9 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.34 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.22 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.09 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  30.34 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  24.05 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.21 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  30.46 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 710 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  22.22 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.16 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  27.49 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.93 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.33 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  26.77 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  26.42 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.07 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.72 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.17 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  26.04 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.6 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.52 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  25.29 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.56 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  25.43 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  25 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1897  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.63 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000214805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  26.12 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  28.28 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  26.19 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.81 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  27.1 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  24.85 
 
 		 455 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.49 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  30.43 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.9 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.81 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  27.16 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.22 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.35 
 
 		 465 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.35 
 
 		 465 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.28 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.96 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  29.52 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  23.63 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  22.82 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.15 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  24.12 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0168  hypothetical protein  25.07 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  23.81 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  25.17 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.21 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.82 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.54 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.86 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  25.17 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.66 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.73 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.42 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 		 479 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  23.49 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.21 
 
 		 452 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.27 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.27 
 
 		 488 aa  60.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  28.86 
 
 		 404 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.17 
 
 		 446 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 413 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.05 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.63 
 
 		 432 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  28.07 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>