206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0252 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0252  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 466 aa  903    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0328  hypothetical protein  95.06 
 
 		 466 aa  837    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00489922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  27.61 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  25.24 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0320  antibiotic ABC transporter  36.36 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0656  bacteriocin ABC transporter, putative  29.52 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0168  hypothetical protein  28.14 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1173  hypothetical protein  23.31 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  21.77 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  33.96 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  22.39 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.2 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  33.64 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.09 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  24.74 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.6 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  23.89 
 
 		 509 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  20.96 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.43 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.38 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  23.68 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.22 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  22.62 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.46 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  25.1 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.41 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.28 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  41.33 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  41.33 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.57 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.12 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  20.63 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  22.06 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.87 
 
 		 430 aa  57  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.98 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  22.3 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  29.73 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  29.73 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.58 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.34 
 
 		 505 aa  54.7  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.8 
 
 		 421 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 		 330 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.14 
 
 		 518 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.01 
 
 		 473 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.33 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  21.6 
 
 		 515 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.14 
 
 		 449 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.97 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.97 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  31.31 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  21.7 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.97 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.07 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.97 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  31.87 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.31 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.27 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.4 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  34.65 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.44 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.16 
 
 		 549 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.07 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  34.15 
 
 		 393 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.38 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  19.07 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  38.27 
 
 		 302 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  19.32 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.08 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.38 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.56 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.04 
 
 		 460 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 576 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 576 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.26 
 
 		 460 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.71 
 
 		 454 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  20.87 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  22.22 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  20.61 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  34.74 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  20.61 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.46 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  41.79 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.26 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  23.96 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  21.06 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.17 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  29.58 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  20.61 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  23.44 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  20.61 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  20.61 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  20.61 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.25 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.07 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.11 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>