117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1351 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1351  chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
726 aa  1467    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.100674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 
589 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  27.09 
 
 
576 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  27.09 
 
 
576 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  26.4 
 
 
523 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  26.23 
 
 
522 aa  97.4  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  37.61 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  36 
 
 
391 aa  72  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  34.65 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  33.66 
 
 
330 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  34.31 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  22.6 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  23.77 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  37.78 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  22.01 
 
 
347 aa  64.3  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.07 
 
 
514 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  32.65 
 
 
377 aa  63.9  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  32.67 
 
 
330 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 
504 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  32.71 
 
 
387 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  26.42 
 
 
460 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.7 
 
 
469 aa  58.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
896 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  26.57 
 
 
467 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5019  hypothetical protein  28.04 
 
 
496 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.97 
 
 
511 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  32.14 
 
 
509 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.33 
 
 
468 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  34.48 
 
 
473 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.48 
 
 
473 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  32.14 
 
 
509 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  40 
 
 
317 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  36.78 
 
 
456 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.78 
 
 
456 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  34.69 
 
 
439 aa  55.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  32.95 
 
 
457 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.93 
 
 
473 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  29.76 
 
 
432 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.78 
 
 
452 aa  54.3  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  34.02 
 
 
498 aa  54.3  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  29.27 
 
 
434 aa  53.9  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.8 
 
 
430 aa  53.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  23.71 
 
 
432 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.08 
 
 
460 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.71 
 
 
466 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.71 
 
 
460 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.1 
 
 
460 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.57 
 
 
479 aa  52  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  23.79 
 
 
441 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.35 
 
 
389 aa  51.2  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.33 
 
 
480 aa  51.2  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.33 
 
 
477 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  35.29 
 
 
460 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  33.33 
 
 
443 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.11 
 
 
460 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  26.67 
 
 
478 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.35 
 
 
480 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.17 
 
 
480 aa  49.7  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
460 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.61 
 
 
449 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.57 
 
 
428 aa  48.9  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  32 
 
 
443 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 
484 aa  48.5  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.58 
 
 
465 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.58 
 
 
465 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  25.22 
 
 
786 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 
404 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  30 
 
 
389 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
460 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
460 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.23 
 
 
447 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.51 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.51 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  32.05 
 
 
439 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.51 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 
457 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.51 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  25 
 
 
445 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.71 
 
 
448 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.13 
 
 
442 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4927  secretion protein HlyD  26.18 
 
 
349 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2302  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.85 
 
 
959 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.676415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  35.8 
 
 
463 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
460 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.88 
 
 
481 aa  46.6  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  26.61 
 
 
396 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.61 
 
 
396 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.61 
 
 
396 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  32.18 
 
 
472 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.29 
 
 
446 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 
491 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.61 
 
 
396 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.61 
 
 
396 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  32.58 
 
 
498 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 
477 aa  45.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  33.75 
 
 
486 aa  45.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.07 
 
 
474 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.8 
 
 
455 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.55 
 
 
451 aa  45.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.51 
 
 
427 aa  44.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>