78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5019 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5019  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  969    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  27.88 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  27.88 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  26.94 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  25.73 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  26.11 
 
 		 522 aa  154  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  21.73 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  27.53 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  23.74 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  24.05 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  24.26 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.57 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  27.27 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  22.78 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.92 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1351  chromosome segregation ATPase-like protein  28.04 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.100674 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  29.03 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  23.62 
 
 		 417 aa  57  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  25.83 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.79 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  26.85 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  21.58 
 
 		 498 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  19.7 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.04 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  22.38 
 
 		 467 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  27.66 
 
 		 376 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.31 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.31 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.39 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  26.87 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.44 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.26 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  19.84 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  21.31 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  21.89 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  26.87 
 
 		 317 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  19.75 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.77 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.77 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  23.77 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  23.77 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  18.68 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.67 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  21.04 
 
 		 549 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.67 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  21.04 
 
 		 549 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.67 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.88 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.44 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  21.52 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.67 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.1 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.87 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.43 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  18.92 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.72 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  18.9 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.15 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  26.28 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.37 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.32 
 
 		 442 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.78 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  23.58 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  19.96 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  31.3 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.22 
 
 		 435 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.68 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  20.08 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  21.14 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  19.38 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  22.48 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  25.3 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  28.57 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  25.57 
 
 		 395 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.91 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  22.68 
 
 		 413 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>