72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1249 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
478 aa  973    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  37.5 
 
 
1209 aa  280  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
1991 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  35.19 
 
 
276 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  35.08 
 
 
268 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  29.12 
 
 
274 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  35.76 
 
 
258 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 
746 aa  79.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  30.25 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  34.69 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  27.09 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  32.32 
 
 
786 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  26.9 
 
 
222 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  26.77 
 
 
294 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  28.77 
 
 
289 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
1239 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  33.1 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
1177 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  32.11 
 
 
985 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  28.14 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
1177 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  27.66 
 
 
958 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  30.2 
 
 
452 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  30.2 
 
 
452 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  25.97 
 
 
678 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  28.17 
 
 
423 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  27.33 
 
 
1182 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  24.9 
 
 
430 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  20.41 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2343  chromosome segregation ATPases-like  25.82 
 
 
684 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.381271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  30.08 
 
 
1232 aa  60.1  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  31.74 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2690  peptidase  24.51 
 
 
607 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466836  normal  0.22304 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  26.04 
 
 
591 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  27.03 
 
 
269 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
1942 aa  50.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1351  chromosome segregation ATPase-like protein  26.67 
 
 
726 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.100674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
673 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  27.2 
 
 
1246 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02600  hypothetical protein  25.26 
 
 
908 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  26.14 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  21.7 
 
 
1143 aa  47.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  24.16 
 
 
269 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22380  hypothetical protein  25.99 
 
 
223 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  23.03 
 
 
1177 aa  47.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.03 
 
 
2468 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.48 
 
 
1211 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.56 
 
 
1698 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  32.14 
 
 
217 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2022  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.051026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1155 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
2099 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
2099 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.49 
 
 
1535 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30 
 
 
2762 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  22.84 
 
 
769 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  23.84 
 
 
3554 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  22.69 
 
 
358 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.6 
 
 
2010 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2662  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  27.19 
 
 
1374 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 
1937 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.88 
 
 
1324 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.72 
 
 
993 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3393  putative PAS/PAC sensor protein  41.79 
 
 
545 aa  43.9  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2452  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.87 
 
 
204 aa  43.9  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633418  normal  0.137413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  28.92 
 
 
998 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
1917 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.14 
 
 
1120 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  29.27 
 
 
856 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.41 
 
 
1138 aa  43.5  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.4 
 
 
1367 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>