More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0801 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0801  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 419 aa  850    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0766  RND family efflux transporter MFP subunit  73.28 
 
 		 407 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0889  RND family efflux transporter MFP subunit  76.49 
 
 		 405 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.436675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0891  RND family efflux transporter MFP subunit  74.81 
 
 		 404 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3337  RND family efflux transporter MFP subunit  73.95 
 
 		 405 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2743  hypothetical protein  69.25 
 
 		 408 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0789  RND family efflux transporter MFP subunit  74.19 
 
 		 405 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3234  RND family efflux transporter MFP subunit  73.95 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0886  RND family efflux transporter MFP subunit  72.39 
 
 		 403 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  67.34 
 
 		 399 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3528  RND family efflux transporter MFP subunit  71.39 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3647  RND family efflux transporter MFP subunit  71.39 
 
 		 403 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0839  RND family efflux transporter MFP subunit  71.39 
 
 		 403 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3453  efflux transporter, RND family, MFP subunit  71.14 
 
 		 403 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0946  hypothetical protein  72.22 
 
 		 375 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2468  RND family efflux transporter MFP subunit  42.93 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17063  normal  0.298309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  42.82 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1711  secretion protein HlyD  42.7 
 
 		 402 aa  294  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2167  RND family efflux transporter MFP subunit  42.6 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  41.31 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2178  RND family efflux transporter MFP subunit  42.9 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  39.79 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  38.99 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  37.34 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0668  Acr family membrane-fusion protein  33.77 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  36.27 
 
 		 422 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06546  hypothetical protein  33.59 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  32.53 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000669  membrane-fusion protein  32.47 
 
 		 385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0329  HlyD family secretion protein  39.64 
 
 		 289 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2268  membrane-fusion protein  30.62 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.250456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0404  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0540732  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  29.85 
 
 		 426 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02659  putative multidrug resistance protein  30.38 
 
 		 379 aa  163  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.73 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1976  RND family efflux transporter MFP subunit  32.92 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.912402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1448  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 		 388 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00133129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3598  RND family efflux transporter MFP subunit  29.98 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  34.7 
 
 		 406 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3933  ATP synthase F1, beta subunit  30.73 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4863  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1849  putative RND efflux system protein, MFP subunit  24.87 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1894  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3902  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 392 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.538028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2448  membrane-fusion protein-like  31.38 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.674132  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3187  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2385  RND family efflux transporter MFP subunit  23.17 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01600  Secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0781997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0742  secretion protein HlyD  27.87 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.460648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  25.84 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.74 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  28.69 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.16 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  25.3 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3095  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  21.84 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0708  secretion protein HlyD  24.67 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.769717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  25.28 
 
 		 366 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.13 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  24.87 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1559  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  22.83 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  24.49 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3037  efflux transporter  23.05 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.732235  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2916  RND family efflux transporter MFP subunit  22.47 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1757  RND family efflux transporter MFP subunit  21.99 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0654458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  26.2 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1939  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.128072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  24.47 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  25.58 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26.88 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  27.61 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3182  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  27.71 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3181  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  28.57 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  32.32 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1187  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.34 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  26.91 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  25.41 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3325  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0390  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  25.2 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  24.86 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>