More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000669 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06546  hypothetical protein  91.69 
 
 		 385 aa  713    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000669  membrane-fusion protein  100 
 
 		 385 aa  785    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0404  RND family efflux transporter MFP subunit  51.44 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0540732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02659  putative multidrug resistance protein  51.2 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2178  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2468  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17063  normal  0.298309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2167  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  35.28 
 
 		 398 aa  213  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1711  secretion protein HlyD  32.71 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0766  RND family efflux transporter MFP subunit  32.91 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2743  hypothetical protein  35.54 
 
 		 408 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  33.95 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  36.92 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0891  RND family efflux transporter MFP subunit  33.94 
 
 		 404 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0801  RND family efflux transporter MFP subunit  32.47 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  30.45 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3234  RND family efflux transporter MFP subunit  34.52 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0789  RND family efflux transporter MFP subunit  34.52 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3337  RND family efflux transporter MFP subunit  34.52 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0889  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.436675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0886  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3647  RND family efflux transporter MFP subunit  35.4 
 
 		 403 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3528  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3453  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.91 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0839  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0946  hypothetical protein  35.49 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0668  Acr family membrane-fusion protein  30.08 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3598  RND family efflux transporter MFP subunit  32.86 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0329  HlyD family secretion protein  32.01 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1976  RND family efflux transporter MFP subunit  29.79 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.912402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1448  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00133129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2268  membrane-fusion protein  30.56 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.250456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  28.36 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3933  ATP synthase F1, beta subunit  28.91 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3902  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 392 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.538028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2385  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1894  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4863  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 		 454 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2448  membrane-fusion protein-like  34.39 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.674132  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3095  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1849  putative RND efflux system protein, MFP subunit  22.59 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3037  efflux transporter  23.19 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.732235  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1058  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 455 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  27.49 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  24.37 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  25.71 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.12 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3187  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  26.68 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.12 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  24.24 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  23.5 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  23.97 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  26.49 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  25.89 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  24.31 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0108  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.39 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  25.6 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  26.33 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  24.22 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  27.36 
 
 		 418 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  24.77 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  23.44 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.48 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.39 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  25.23 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  27.31 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  34.01 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>