More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3187 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3187  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 439 aa  871    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  33.64 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  34.02 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2916  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1058  RND family efflux transporter MFP subunit  38.23 
 
 		 455 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3095  RND family efflux transporter MFP subunit  35.94 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3566  RND family efflux transporter MFP subunit  33.89 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2205  membrane-fusion protein  33 
 
 		 455 aa  216  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  35 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1757  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0654458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0668  Acr family membrane-fusion protein  29.09 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1711  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  25.24 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  26.68 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0766  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 407 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0801  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 419 aa  103  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2167  RND family efflux transporter MFP subunit  25.06 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2468  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17063  normal  0.298309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  26.91 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 422 aa  97.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2178  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569446  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06546  hypothetical protein  25.96 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000669  membrane-fusion protein  24.93 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2743  hypothetical protein  25.74 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  25.55 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.3 
 
 		 410 aa  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0891  RND family efflux transporter MFP subunit  23.3 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0889  RND family efflux transporter MFP subunit  24.4 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.436675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  24.76 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3598  RND family efflux transporter MFP subunit  24.43 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0789  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3337  RND family efflux transporter MFP subunit  23.98 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3037  efflux transporter  26.9 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.732235  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0886  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  27.19 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2268  membrane-fusion protein  23.4 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.250456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0946  hypothetical protein  24.05 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1849  putative RND efflux system protein, MFP subunit  22.65 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  32.09 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0839  RND family efflux transporter MFP subunit  23.35 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3647  RND family efflux transporter MFP subunit  22.84 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3528  RND family efflux transporter MFP subunit  23.35 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3453  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.35 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0404  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0540732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  25.18 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.28 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0329  HlyD family secretion protein  26.49 
 
 		 289 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  24.94 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  26.06 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  26.06 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  26.06 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  24.2 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  24 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.94 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  23.18 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  24.18 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  24.36 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  24.13 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  23.59 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  25.96 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  26.41 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1968  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.92 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000223491  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  23.46 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  21.32 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  24.4 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.53 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  23.45 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  26.89 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  25.46 
 
 		 514 aa  67  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>