More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01600 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01600  Secretion protein HlyD  100 
 
 		 390 aa  784    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0781997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0708  secretion protein HlyD  37.57 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.769717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.75 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1638  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000343262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0766  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0801  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  21.36 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  24 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  21.61 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2743  hypothetical protein  24.01 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  26.63 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0891  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3337  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0789  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0889  RND family efflux transporter MFP subunit  25.67 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.436675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  23.78 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0390  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  26.57 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0886  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0946  hypothetical protein  24.61 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0839  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3528  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3647  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  26 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3453  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.37 
 
 		 360 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.37 
 
 		 360 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  23.68 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.53 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  22.42 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.91 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.8 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  22.97 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  19.04 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  19.4 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  24.58 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1953  RND family efflux transporter MFP subunit  22.75 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  24.02 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  23.11 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  23.01 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  22.71 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1976  RND family efflux transporter MFP subunit  22.61 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.912402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  26.24 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  23.44 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2268  membrane-fusion protein  19.3 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.250456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.36 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  29.17 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  23.4 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  22.22 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  25.1 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  20.75 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  25.1 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  25.1 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  21.3 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  23.99 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  24.48 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.11 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  21.39 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  27.49 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  29.6 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  23.94 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  21.07 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  23.71 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.12 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  22.78 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2512  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  22.78 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  28.67 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0404  RND family efflux transporter MFP subunit  22.65 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0540732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.94 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  23.95 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  28.67 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  28.67 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000669  membrane-fusion protein  21.48 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  22.99 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.53 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  20 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  28.67 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  22.13 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>