More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0236 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
379 aa  723    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  95.53 
 
 
380 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  95.79 
 
 
380 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  66.02 
 
 
397 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  31.99 
 
 
370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  31.91 
 
 
367 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  31.78 
 
 
376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1044  nodulation protein NolF  34.24 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.991845  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.1 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.28 
 
 
362 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  36.54 
 
 
362 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.35 
 
 
388 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 
358 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.63 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  31.86 
 
 
382 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  30.84 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 
372 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.46 
 
 
408 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.65 
 
 
408 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  29.7 
 
 
414 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
472 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  26.43 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  31.06 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.21 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  32.38 
 
 
366 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  30.72 
 
 
400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  30.67 
 
 
382 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  25.45 
 
 
368 aa  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.74 
 
 
425 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  29.51 
 
 
361 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  31.69 
 
 
385 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  32.92 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  26.32 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  32.92 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  30.03 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  31.49 
 
 
398 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  33.55 
 
 
391 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  26.98 
 
 
367 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 
377 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 
340 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  26.97 
 
 
368 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  23.24 
 
 
372 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  28.48 
 
 
409 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  27.76 
 
 
360 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  23.04 
 
 
372 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  28.61 
 
 
427 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 
360 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  29.24 
 
 
399 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 
360 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  31.66 
 
 
409 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 
360 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 
362 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 
364 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 
360 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
360 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 
372 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 
361 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  26.15 
 
 
451 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  26.27 
 
 
368 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 
426 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 
380 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.48 
 
 
369 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1668  secretion protein HlyD  29.24 
 
 
409 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  29.7 
 
 
419 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  33.13 
 
 
430 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.6 
 
 
353 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 
360 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 
360 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 
352 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 
391 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 
386 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  29.78 
 
 
360 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  35.06 
 
 
392 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.39 
 
 
471 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 
389 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  31.03 
 
 
351 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  30.72 
 
 
391 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 
415 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 
374 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  30.49 
 
 
376 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 
360 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  29.24 
 
 
380 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.98 
 
 
379 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.98 
 
 
379 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 
383 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  26.5 
 
 
359 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  30.18 
 
 
357 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  33.12 
 
 
360 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  30.42 
 
 
440 aa  103  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 
400 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 
455 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>