160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0812 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 382 aa  769    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.49 
 
 		 387 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0708  secretion protein HlyD  49.35 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.769717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1638  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.9 
 
 		 373 aa  352  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000343262  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01600  Secretion protein HlyD  35.75 
 
 		 390 aa  250  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0781997  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  23.41 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  22.53 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3037  efflux transporter  22.22 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.732235  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  21.71 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.47 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4647  RND family efflux transporter MFP subunit  21.87 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  22.14 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  22.05 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.75 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.43 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  19.78 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  23.34 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  23.92 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  24.54 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1044  nodulation protein NolF  24.7 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.991845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.57 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  21.69 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  23.55 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  22.82 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  26.24 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  26.73 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1531  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000126911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.26 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  35 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  21.91 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  21.66 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.29 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  24.44 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.1 
 
 		 1462 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  27.87 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.54 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.18 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.57 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1671  AcrA-like protein  23.53 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0632111  normal  0.139381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  36 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  23.62 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  21.28 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  24.27 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  22.99 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  20.89 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  21.97 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1741  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  23.92 
 
 		 457 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  23.92 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  24.65 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1576  hypothetical protein  20.71 
 
 		 538 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000469738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1849  putative RND efflux system protein, MFP subunit  21.38 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3429  secretion protein HlyD  39.08 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  23.92 
 
 		 457 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  21.75 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.33 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  25.87 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  25.51 
 
 		 283 aa  46.2  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 		 360 aa  46.2  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4863  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.61 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.71 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  30 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1711  secretion protein HlyD  21.61 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000765458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.68 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  25.11 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01700  RND family efflux system membrane fusion protein  25.51 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  22.61 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  20.54 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  24 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  26.18 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3447  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  21.36 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>