More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2192 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 373 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  31.21 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0309  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  26.04 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.63 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0508  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.88 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.860748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1705  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.88 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  29.05 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.92 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  27.69 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.08 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  23.01 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  23.1 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.1 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  24.31 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.09 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.870184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  24.27 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3894  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4262  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  25.95 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  23.87 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4376  RND family efflux transporter MFP subunit  25.67 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.349604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  27.33 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  28.29 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  29.03 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  25 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01700  RND family efflux system membrane fusion protein  24.54 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 538 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  25.32 
 
 		 405 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  20.8 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4768  RND family efflux transporter MFP subunit  22.32 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  24.92 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.32 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  24 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  25.32 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  24.21 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  24.33 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  24.92 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  23.26 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.61 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.89 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  27.85 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.89 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.74 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0045  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.61 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  23.44 
 
 		 683 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.31 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  22.57 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 		 715 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  21.83 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.12 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0787  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.91 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  25.91 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  25 
 
 		 509 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  23.18 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  22.67 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  23.97 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  27.14 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>