250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1636 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 387 aa  773    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.49 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1638  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.44 
 
 		 373 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000343262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0708  secretion protein HlyD  50.84 
 
 		 381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.769717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01600  Secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 390 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0781997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  25.92 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  22.22 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  24.68 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  23.78 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  35.43 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  23.06 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  23.53 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  23.79 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  24.8 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 456 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  23.93 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0298  membrane-fusion protein-like protein  26.42 
 
 		 271 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  23.61 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  20.91 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.77 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  23.49 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  24.29 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3598  RND family efflux transporter MFP subunit  24.52 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  24.75 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  21.71 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  22.01 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  21.45 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1849  putative RND efflux system protein, MFP subunit  22.45 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  25.63 
 
 		 267 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  25.81 
 
 		 251 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 		 497 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  25.97 
 
 		 283 aa  53.5  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 378 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  26.44 
 
 		 252 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.64 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  24.03 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  21.99 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  23.25 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  31.13 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 466 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  24.3 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.17 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.06 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  28.68 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  24.63 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.39 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 		 552 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  22.73 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2448  membrane-fusion protein-like  22.32 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.674132  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  22.7 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0476  RND family efflux transporter MFP subunit  24.4 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.85 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.85 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  24.79 
 
 		 267 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  25.64 
 
 		 381 aa  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 1462 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  22.73 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  21.03 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.54 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  26.27 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  26.47 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  27.61 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  22.31 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.88 
 
 		 497 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  26.89 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.63 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>