More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0907 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  98.02 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2054  secretion protein HlyD family protein  66.94 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0298  membrane-fusion protein-like protein  52.83 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  43.75 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0419  membrane-fusion protein  40.17 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0145  hypothetical protein  40.67 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0370  hypothetical protein  36.53 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.131053  normal  0.52823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0668  hypothetical protein  38.22 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.013392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  36.75 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  37.71 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5409  hypothetical protein  37.73 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1671  AcrA-like protein  33.61 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0632111  normal  0.139381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0477  hypothetical protein  36.82 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3072  hypothetical protein  33.49 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3183  AcrA-like protein  32.37 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1151  hypothetical protein  30.13 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  36.77 
 
 		 369 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  30.24 
 
 		 358 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 374 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  28.38 
 
 		 350 aa  85.1  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  27.48 
 
 		 352 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  26.03 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  27.52 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2870  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.551784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 364 aa  75.1  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  27.43 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.89 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  28.24 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  26.13 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 380 aa  72  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  28.93 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  28.51 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  27.62 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  27.94 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  28.39 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  22.97 
 
 		 365 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  26.73 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  27.81 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  27.16 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  25.98 
 
 		 434 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 373 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  25.99 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  25 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  25.35 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  23.55 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1310  secretion protein HlyD  27.36 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.673983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  27.05 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  23.44 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  25.98 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3571  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239658  normal  0.276589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  26.87 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.71 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000138483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 390 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1280  putative multidrug resistance protein  24.31 
 
 		 343 aa  62  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  22.37 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  27.32 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  32.35 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000256578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  22.27 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  23.12 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.78 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  23.42 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0695  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0674  periplasmic linker protein  26.57 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>