More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1151 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1151  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1671  AcrA-like protein  36.32 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0632111  normal  0.139381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3072  hypothetical protein  34.6 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0370  hypothetical protein  37.68 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.131053  normal  0.52823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5409  hypothetical protein  35.21 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  39.44 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  39.44 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0298  membrane-fusion protein-like protein  36.74 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  33.65 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0668  hypothetical protein  37.09 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.013392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  35.02 
 
 		 283 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0477  hypothetical protein  36.15 
 
 		 268 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3183  AcrA-like protein  33.02 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0145  hypothetical protein  33.96 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2054  secretion protein HlyD family protein  33.95 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  31 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  30.13 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0419  membrane-fusion protein  32.71 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.7 
 
 		 375 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 394 aa  75.5  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  25.73 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.71 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7712  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 383 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  26.24 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  22.91 
 
 		 352 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 		 388 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 467 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  23.83 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  23.33 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  27.75 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.98 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 434 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 415 aa  65.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1316  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  24.15 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.45 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  25.12 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.91 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.39 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  24.31 
 
 		 365 aa  62.4  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  24.89 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  23.61 
 
 		 357 aa  62  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  23.21 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  24.03 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  24.55 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.6 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3695  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  25.52 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  21.5 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  28.09 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  25.24 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  30.56 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  23.61 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0621  secretion protein HlyD  26.79 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.59 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  24.6 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  23.36 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  23.58 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  25.34 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  24.65 
 
 		 369 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  25.76 
 
 		 368 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  23.15 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  23.66 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  25.12 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.1 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  23.64 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2816  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  23.66 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  22.69 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  26.01 
 
 		 360 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1372  membrane-fusion protein-like protein  26.44 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  23.45 
 
 		 418 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  27.35 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  22.94 
 
 		 377 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  25.51 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 		 390 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>