283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3183 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3183  AcrA-like protein  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1671  AcrA-like protein  43.78 
 
 		 242 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0632111  normal  0.139381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  35 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0477  hypothetical protein  34.96 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0298  membrane-fusion protein-like protein  33.65 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  34.23 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0145  hypothetical protein  32.86 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1151  hypothetical protein  33.02 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2054  secretion protein HlyD family protein  31.13 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0668  hypothetical protein  35.78 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.013392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  33.83 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  32.37 
 
 		 252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  29.8 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0370  hypothetical protein  27.45 
 
 		 274 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.131053  normal  0.52823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0419  membrane-fusion protein  32.08 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3072  hypothetical protein  27.76 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5409  hypothetical protein  29.03 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000138483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  25.82 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2342  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 370 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.15 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 376 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  24.36 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  22.75 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  23.64 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  23.18 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  24.88 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 353 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 363 aa  62  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.12 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1570  RND family efflux transporter MFP subunit  24.39 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.628485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  21.66 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  25 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.27 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2871  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  23.17 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  23.15 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  20.2 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2051  RND family efflux transporter MFP subunit  22.05 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0552963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  22.07 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  28.7 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0318  secretion protein HlyD family protein  24.78 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.844809  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003810  linker protein putative  29.03 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  26.45 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  25.51 
 
 		 631 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  20.76 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1316  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0457326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  21.43 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  26.73 
 
 		 387 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2674  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0130408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1246  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.84 
 
 		 388 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  23.47 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  24.41 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1280  putative multidrug resistance protein  21.36 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  26.01 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01876  hypothetical protein  29.41 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  22.64 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2635  RND family efflux transporter MFP subunit  22.58 
 
 		 370 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0171634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  26.22 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  20.28 
 
 		 372 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2397  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.689244  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.52 
 
 		 374 aa  53.1  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 354 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 		 425 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2356  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  23.35 
 
 		 373 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1474  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 		 354 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0567853  normal  0.0481881 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 396 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.77 
 
 		 380 aa  52.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 361 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  21.8 
 
 		 358 aa  52  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 375 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 405 aa  52  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  21.62 
 
 		 397 aa  52  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 364 aa  52  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0750  hypothetical protein  23.63 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  23.44 
 
 		 354 aa  52  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1176  hypothetical protein  22.46 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0174847  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  25.4 
 
 		 383 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1051  hypothetical protein  22.46 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.94 
 
 		 372 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  27.39 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  25.4 
 
 		 383 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  21.15 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  21.3 
 
 		 365 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  23.65 
 
 		 354 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  32.31 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 376 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>