More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2356 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2356  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2674  secretion protein HlyD family protein  91.47 
 
 		 289 aa  510  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0130408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2397  secretion protein HlyD family protein  91.81 
 
 		 289 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.689244  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0923  secretion protein HlyD  35.98 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00699557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3234  hypothetical protein  39.34 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475662  normal  0.284484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0621  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 245 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1344  secretion protein HlyD  40.23 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.44179  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2174  hypothetical protein  34.03 
 
 		 261 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043286  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 359 aa  86.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 354 aa  86.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  28.51 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.83 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.1 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  26.89 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  27.13 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  27.27 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 407 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4768  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176985 
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  27.56 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4376  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.349604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  27.56 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3429  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  30.22 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  29.91 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  26.89 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.39 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  26.5 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  27.72 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.99 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.3 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.24 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  24.28 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.92 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  28.52 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  26.09 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.89 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0045  RND family efflux transporter MFP subunit  28.45 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 405 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  26.59 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  26.26 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  28.44 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1409  membrane-fusion protein-like  25.7 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  23.43 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1389  HlyD family secretion protein  25.9 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379904  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  25.99 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  23.13 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  23.55 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  27.87 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  25.48 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.39 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.04 
 
 		 531 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.6 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0171  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  27.36 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>