More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2054 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2054  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  66.94 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  66.26 
 
 		 251 aa  318  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0298  membrane-fusion protein-like protein  46.61 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  45.45 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0419  membrane-fusion protein  40.18 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0370  hypothetical protein  37.04 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.131053  normal  0.52823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5409  hypothetical protein  38.97 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0145  hypothetical protein  38.76 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3072  hypothetical protein  34.31 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  36.23 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  36.67 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  36.19 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0477  hypothetical protein  34.88 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1671  AcrA-like protein  33.03 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0632111  normal  0.139381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0668  hypothetical protein  33.85 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.013392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3183  AcrA-like protein  31.13 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1151  hypothetical protein  33.95 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 		 374 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  30.24 
 
 		 358 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  30.15 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 366 aa  75.5  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.98 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  26.47 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  26.01 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  25 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1310  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.673983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  26.15 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.34 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.63 
 
 		 383 aa  72.4  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  23.76 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  25.58 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  28.74 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.92 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  25.98 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 364 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  27.35 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.24 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  26.95 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  23.5 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  27.91 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0630  secretion protein HlyD  25.36 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0232449  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.6 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.16 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  29.95 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  25.45 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  24.55 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  27.54 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  28.44 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  22.54 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.82 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  25 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  28.05 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  24.52 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 417 aa  62  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.975013  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  27.32 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  26.22 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  27.4 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  25.89 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1280  putative multidrug resistance protein  25.71 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  27.8 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.6 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2870  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.551784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>