More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0370 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.131053  normal  0.52823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  36.53 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  36.24 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2054  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0298  membrane-fusion protein-like protein  32.69 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1151  hypothetical protein  37.68 
 
 		 245 aa  145  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  37.33 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3072  hypothetical protein  34.15 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0419  membrane-fusion protein  34.3 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0145  hypothetical protein  36.59 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5409  hypothetical protein  35.44 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  33.2 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  34.55 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1671  AcrA-like protein  31.67 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0632111  normal  0.139381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0477  hypothetical protein  32.4 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  34.3 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0668  hypothetical protein  35.38 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.013392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3183  AcrA-like protein  27.45 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.37 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 351 aa  82.4  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  28.83 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2870  RND family efflux transporter MFP subunit  23.35 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.551784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  25.56 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 376 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  30.63 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3664  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  26.11 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  26.83 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.39 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000138483  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  30 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  23.5 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  25 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  25.12 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0630  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0232449  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000227  periplasmic linker protein  24.88 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  21.69 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  26.25 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.11 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  25.38 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1730  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.674972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  20.56 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2473  RND family efflux transporter MFP subunit  29.25 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000483953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.56 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  22.64 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2567  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  22.97 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  30.63 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  23.72 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  30.63 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  31.9 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  30.63 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.27 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  25.74 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24.76 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  21.33 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0510  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0586812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  28.68 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.67 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  28.14 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  25.29 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4144  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.473768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>