More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0388 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0569  secretion protein HlyD family protein  74.34 
 
 		 267 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0474  hypothetical protein  73.31 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0477  hypothetical protein  76.69 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0145  hypothetical protein  58.14 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0668  hypothetical protein  60.34 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.013392 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1671  AcrA-like protein  36.65 
 
 		 242 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0632111  normal  0.139381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0298  membrane-fusion protein-like protein  40.18 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  37.71 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  37.92 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  31.7 
 
 		 265 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2054  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1151  hypothetical protein  35.38 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3183  AcrA-like protein  35 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0419  membrane-fusion protein  35.21 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3072  hypothetical protein  34.43 
 
 		 250 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0370  hypothetical protein  34.3 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.131053  normal  0.52823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5409  hypothetical protein  32.55 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 		 357 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 374 aa  85.9  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  23.95 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  27.49 
 
 		 467 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  26.94 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.44 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  24.88 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  27.01 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  27.5 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2871  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.27 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  27.31 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  22.83 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  25.35 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26.48 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  22.27 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  28.64 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  31.14 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.3 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  26.46 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  24.36 
 
 		 375 aa  68.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  28.71 
 
 		 388 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  24.66 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  29.25 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  23.61 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  25.59 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 389 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.82 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  25.93 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  25.11 
 
 		 415 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  29.86 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  23.08 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0900  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  29.94 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  23.83 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0887  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  24.52 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.82 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  25.55 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.82 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0510  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0586812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  24.42 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2715  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.2 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>