107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0035 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0035  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 360 aa  734    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2052  hypothetical protein  32.7 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0197  hypothetical protein  32.93 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  26.27 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0182  membrane-fusion protein-like protein  20.82 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.109669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0187  hypothetical protein  20.82 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1361  hypothetical protein  24.81 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00937892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  24.26 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  24.4 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  23.96 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  23.96 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  23.96 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0275  hypothetical protein  23.63 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00043539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  24.1 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  24.1 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  23.26 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0014  RND efflux transporter  20.73 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  23.08 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  23.66 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  23.58 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  24.4 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  22.78 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  23.88 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  22.56 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.75 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.18 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  23.55 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  23.38 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  23.34 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0695  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.41 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  23.44 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.71 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  21.19 
 
 		 394 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3980  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.57 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  21.39 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  22.31 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  22.31 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  23.03 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  22.31 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.66 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.34 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.82 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.31 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  22.31 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.62 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  26.5 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  26.38 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  26.5 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.39 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  25.59 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  25.56 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.59 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.59 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  22.01 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  22.87 
 
 		 425 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  20.22 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2774  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000348854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  22.27 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.08 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.86 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.3 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.15 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  20.53 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  27.85 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  22.32 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  23.43 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.87 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.04 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  26.96 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1409  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  26.96 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2420  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  26.96 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  26.96 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.4 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.27 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.86 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6029  acriflavin resistance protein A  21.52 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.85 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  22.02 
 
 		 533 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0961  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.3 
 
 		 607 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.85 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.26 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  30.09 
 
 		 500 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  26.9 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.98 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>