297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3787 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  89.39 
 
 
394 aa  712    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  88.92 
 
 
397 aa  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  88.16 
 
 
397 aa  709    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  88.16 
 
 
397 aa  706    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  87.91 
 
 
397 aa  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  88.41 
 
 
397 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  89.17 
 
 
397 aa  714    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
395 aa  788    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  88.16 
 
 
397 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  83.59 
 
 
395 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  89.67 
 
 
397 aa  714    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  88.66 
 
 
397 aa  708    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  29.24 
 
 
367 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  30.1 
 
 
368 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  29.84 
 
 
368 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  29.77 
 
 
368 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  29.58 
 
 
368 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  29.77 
 
 
368 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  30.29 
 
 
367 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  30.03 
 
 
367 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  29.77 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 
367 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  29.32 
 
 
367 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  29.16 
 
 
376 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 
393 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1361  hypothetical protein  25.42 
 
 
414 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00937892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.89 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.57 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  22.02 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.57 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  22.99 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0228  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 
465 aa  64.3  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.43 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  22.44 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  21.54 
 
 
364 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  23.99 
 
 
431 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.89 
 
 
362 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0014  RND efflux transporter  22.42 
 
 
372 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0182  membrane-fusion protein-like protein  22.89 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.109669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  21.64 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.29 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0187  hypothetical protein  22.89 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  23.41 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  22.06 
 
 
467 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.63 
 
 
437 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.63 
 
 
437 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  23.63 
 
 
364 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  19.31 
 
 
384 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  22.34 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  21.89 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.02 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.54 
 
 
580 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  23.53 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  23.15 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.19 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.53 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.82 
 
 
349 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.05 
 
 
407 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.36 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  21.82 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.26 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.47 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.86 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.86 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  23.89 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.32 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  22.46 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  19.41 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  22.22 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  23.24 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  22.19 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.69 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  27.66 
 
 
401 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  21.59 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.29 
 
 
453 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  22.07 
 
 
449 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  22.07 
 
 
407 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  21.82 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  20.75 
 
 
354 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1331  RND family efflux transporter MFP subunit  23 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  22.84 
 
 
435 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.45 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0275  hypothetical protein  21.54 
 
 
317 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00043539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  24.84 
 
 
366 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.08 
 
 
412 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 
354 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.180858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  22.77 
 
 
629 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  23.55 
 
 
390 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 
502 aa  53.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  21.26 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>