More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0654 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
367 aa  729    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  80.93 
 
 
367 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  81.32 
 
 
367 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  81.2 
 
 
367 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  81.04 
 
 
367 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  81.1 
 
 
368 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  80.55 
 
 
368 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  80.55 
 
 
368 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  80.27 
 
 
368 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  79.08 
 
 
368 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  78.75 
 
 
367 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.13 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 
397 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 
397 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 
397 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 
397 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  31.54 
 
 
397 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 
394 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.54 
 
 
397 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.9 
 
 
395 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.28 
 
 
397 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  31.11 
 
 
397 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  29.24 
 
 
395 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  30.41 
 
 
376 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1361  hypothetical protein  25.33 
 
 
414 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00937892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.67 
 
 
379 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.47 
 
 
393 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  25.43 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.14 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  24.81 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.86 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0801  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 
417 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.85 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  22.85 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  23.85 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  23.05 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.09 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  22.31 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  21.97 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  20.11 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  25.25 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.07 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.87 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  24.51 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.57 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  21.92 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  21.07 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.71 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  21.88 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  22.19 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  25.07 
 
 
408 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  23.31 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  25.65 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.65 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.01 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.89 
 
 
405 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  20.59 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  22.22 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.85 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.54 
 
 
350 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  22.48 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2052  hypothetical protein  24.87 
 
 
346 aa  63.5  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  24.8 
 
 
408 aa  63.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 
438 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2231  multidrug resistance efflux pump-like  25.3 
 
 
325 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.36 
 
 
505 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.51 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  24.31 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  21.73 
 
 
450 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.40893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  24.67 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  23.77 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  24.67 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  23.23 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.85 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  22.9 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  21.93 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  23.84 
 
 
338 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  24.66 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  24.01 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  21.9 
 
 
400 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  24.01 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  24.01 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  24.01 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  22.19 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  24.34 
 
 
371 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  22.04 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 
622 aa  60.1  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  24.25 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>