236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2231 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2231  multidrug resistance efflux pump-like  100 
 
 		 325 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2063  hypothetical protein  29.5 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  33.6 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.53 
 
 		 431 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.25 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  34.78 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  25.47 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.47 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  29.6 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  34.45 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  26.01 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.31 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  29.37 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  32.11 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  31.43 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.83 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  31.36 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 497 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.36 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  25.83 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.36 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  25.22 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  27.31 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  34.75 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  34.75 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  24.7 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  28.45 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  34.75 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  29.55 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  34.75 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 		 409 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  27.07 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  26.42 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  21.92 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  24.54 
 
 		 459 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  26.83 
 
 		 345 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 345 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.24 
 
 		 417 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  23.24 
 
 		 417 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  29.66 
 
 		 410 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  24.29 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  23.55 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  23.88 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.89 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.46 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.07 
 
 		 705 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  26.06 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 427 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  22.89 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  28.93 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.77 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  25.88 
 
 		 425 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.22 
 
 		 430 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  25.96 
 
 		 413 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  25.82 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 409 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  24.23 
 
 		 372 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  23.17 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  23.17 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  21.69 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 369 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  29.27 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3718  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 461 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  30 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  21.81 
 
 		 444 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 		 349 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.49 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  23.17 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  23.17 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  23.17 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  26.29 
 
 		 449 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  22.43 
 
 		 455 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  23.17 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.71 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3732  secretion protein HlyD family protein  21.99 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>