More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_0709 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  98.09 
 
 
367 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  98.37 
 
 
368 aa  713    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  100 
 
 
367 aa  724    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  98.91 
 
 
368 aa  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  95.65 
 
 
368 aa  695    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  99.18 
 
 
367 aa  718    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  98.1 
 
 
368 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  95.37 
 
 
367 aa  693    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  98.37 
 
 
368 aa  713    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  96.19 
 
 
367 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  81.32 
 
 
367 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.31 
 
 
397 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 
395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.28 
 
 
397 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  31.03 
 
 
397 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 
397 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.54 
 
 
397 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 
397 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 
397 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
397 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  30.77 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  28.87 
 
 
376 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1361  hypothetical protein  24.86 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00937892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.08 
 
 
392 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.86 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.38 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  25.68 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  24.53 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  23.2 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.29 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  24.86 
 
 
449 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 
347 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2052  hypothetical protein  25.8 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  24.29 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  24.43 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.97 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.59 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 
453 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  24.67 
 
 
353 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  22 
 
 
407 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.66 
 
 
386 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.47 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.4 
 
 
426 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  22.42 
 
 
450 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  23.61 
 
 
376 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  22.41 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  23.75 
 
 
357 aa  59.3  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.57 
 
 
354 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0035  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  21.96 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  22.03 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0801  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.85 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  24.59 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  21.36 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  21.85 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.35 
 
 
471 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.28 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  22.77 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.25 
 
 
403 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  23.93 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.77 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  22.77 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.14 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  21.26 
 
 
366 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.14 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 
383 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 
414 aa  56.2  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  23.1 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.09 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  23.03 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1438  secretion protein HlyD  33.82 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.45 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  24.03 
 
 
622 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  21.84 
 
 
435 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  23.03 
 
 
517 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  22.57 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6029  acriflavin resistance protein A  23.3 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.58 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  25.5 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.44 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>