247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_4937 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  95.21 
 
 
397 aa  761    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  98.49 
 
 
397 aa  780    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  85.89 
 
 
395 aa  675    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  99.75 
 
 
397 aa  791    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  100 
 
 
397 aa  794    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  99.24 
 
 
397 aa  787    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  99.75 
 
 
397 aa  791    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  93.7 
 
 
394 aa  739    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  98.49 
 
 
397 aa  781    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  94.71 
 
 
397 aa  758    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  99.24 
 
 
397 aa  786    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  88.16 
 
 
395 aa  706    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  31.28 
 
 
367 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  31.03 
 
 
367 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  31.03 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  30.77 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  31.03 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  31.03 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  31.11 
 
 
368 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  30.77 
 
 
368 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 
367 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  30.77 
 
 
367 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  28.89 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1361  hypothetical protein  26.92 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00937892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.12 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.13 
 
 
391 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.33 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.34 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.32 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.3 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  22.11 
 
 
431 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  23.74 
 
 
467 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  21.32 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.08 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  21.29 
 
 
431 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.36 
 
 
453 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  21.95 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  22.13 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  23.7 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 
580 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  24.26 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0014  RND efflux transporter  22.05 
 
 
372 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  21.9 
 
 
322 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.59 
 
 
419 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 
347 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  23.77 
 
 
641 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.28 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0228  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.75 
 
 
465 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  22.19 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  21.25 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  20.64 
 
 
409 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.51 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.26 
 
 
354 aa  57.4  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  21.32 
 
 
409 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  22.86 
 
 
419 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  22.67 
 
 
398 aa  56.2  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3732  secretion protein HlyD family protein  21.69 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.52 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  21.94 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  22.12 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  32.22 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  23.65 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  21.49 
 
 
465 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.13 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  22.38 
 
 
451 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.28 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.37 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  21.39 
 
 
364 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.14 
 
 
455 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  20.94 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  21.92 
 
 
449 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.38 
 
 
362 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  22.39 
 
 
396 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.5 
 
 
424 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  21.2 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.28 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  21.24 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.81 
 
 
549 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.82 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.28 
 
 
402 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.46 
 
 
387 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  30.1 
 
 
411 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.56 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  20.29 
 
 
392 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0182  membrane-fusion protein-like protein  21.31 
 
 
370 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.109669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0187  hypothetical protein  21.31 
 
 
370 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0275  hypothetical protein  20.37 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00043539  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  22.95 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  23.33 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  21.63 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  22.22 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.92 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.18 
 
 
346 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>