43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0182 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0187  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  740    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0182  membrane-fusion protein-like protein  100 
 
 
370 aa  740    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.109669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0014  RND efflux transporter  49 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2052  hypothetical protein  24.17 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  24.51 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  22.89 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0035  RND family efflux transporter MFP subunit  20.41 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 
395 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.5 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.01 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  21.55 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.55 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.31 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  21.31 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  21.31 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  21.31 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  21.31 
 
 
397 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  22.46 
 
 
394 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  22.25 
 
 
368 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  22.64 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  22.25 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  22.25 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  22.25 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  22 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  22.39 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.36 
 
 
393 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  22 
 
 
367 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0197  hypothetical protein  25.1 
 
 
276 aa  46.2  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  22 
 
 
368 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.7 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  21.25 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  29.9 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.92 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 
423 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0992  secretion protein HlyD  29.47 
 
 
382 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  31.03 
 
 
409 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  38.57 
 
 
357 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.63 
 
 
372 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0708  secretion protein HlyD  27.42 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.769717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>