31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0197 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0197  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  552  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2052  hypothetical protein  34.13 
 
 
346 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0035  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.27 
 
 
431 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 
367 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 
431 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0275  hypothetical protein  27.75 
 
 
317 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00043539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  27.67 
 
 
367 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 
367 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  27.67 
 
 
368 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  27.04 
 
 
368 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  27.04 
 
 
367 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  28.21 
 
 
367 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  27.04 
 
 
368 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  27.04 
 
 
368 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  27.04 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0014  RND efflux transporter  22.66 
 
 
372 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  26.42 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 
361 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0182  membrane-fusion protein-like protein  25.1 
 
 
370 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.109669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0187  hypothetical protein  25.1 
 
 
370 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  26.77 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 
500 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 
517 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.21 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 
421 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  23.47 
 
 
402 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.56 
 
 
413 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  23.81 
 
 
338 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.24 
 
 
379 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.144925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>