27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0275 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0275  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  616  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00043539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2052  hypothetical protein  27.32 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  20.9 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.16 
 
 		 395 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  21.54 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0035  RND family efflux transporter MFP subunit  23.02 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  20.53 
 
 		 394 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0197  hypothetical protein  26.01 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  20.37 
 
 		 397 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  20.37 
 
 		 397 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  20.37 
 
 		 397 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.84 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.37 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 397 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  25.49 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.05 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  30.71 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.6 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  23.6 
 
 		 371 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  23.6 
 
 		 371 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  23.6 
 
 		 371 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  23.6 
 
 		 371 aa  42.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  23.6 
 
 		 371 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  23.6 
 
 		 371 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  23.6 
 
 		 371 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>